有机肥，主要指各种动物粪便，动植物遗体经过一定时期发酵腐熟后形成的肥料（其中包括经过加工的菜籽饼、豆饼等，是没有异味的）。有机肥含有大量有机物质、动植物残体、排泄物、生物废物等物质、施用有机肥料不仅能为农作物提供全面的营养，而且肥效时间长，可增加和更新土壤有机质，促进微生物繁殖，改善土壤的理化性质和生物活性，是绿色食品生产的主要养分来源。
堆肥，以各类秸秆、落叶、青草、动植物残体、人畜粪便为原料，与少量泥土混合堆积而成的一种有机肥料。
沤肥，所用原料与堆肥基本相同，只是在水淹情况下进行发酵而成。
厩肥，指猪、牛、马、羊、鸡、鸭等畜禽的粪尿与秸秆垫料堆沤制成的肥料。如豆科的绿豆、蚕豆、草木犀、田菁、苜蓿、笤子等。非豆科绿肥有黑麦草、肥田萝卜、小葵子、满江红、水葫芦、水花生等。
作物秸秆，农作物秸秆是重要的有机肥之一，作物秸秆含有农作所必须的营养元素，有N、P、K、Ga、S等。在适宜条件下通过土壤微生物的作用，这些元素经过矿化再回到土壤中，为作物吸收利用。饼肥有菜籽肥、棉籽肥、豆饼、芝麻饼、蓖麻饼、茶籽饼等。
泥肥，未经污染的河泥、塘泥、沟泥、港泥、湖泥等。
现在，随着科学技术的不断发展，通过有益菌的人工纯培养技术，采用科学的提炼，可以生产出多种多样不同品种的生物有机肥，它能改善土质、减少环境污染、增肥增效等。生物有机肥将是未来农业生产用肥的主要发展趋势。
